Septembri õhutemperatuuri päevarekordite purunemised on avaldanud oma mõju ka merepinna temperatuurile Eesti rannikul. TalTechi satelliitpiltide analüüs näitab, et kõikjal Eesti rannikumeres on merepinna temperatuur 17–18 kraadi juures.

Seda kinnitavad ka ranniku seirejaamade andmed. Vee temperatuur on oluliselt kõrgem kui viimasel 30 aastal keskmiselt septembrikuus. Septembri keskpaigale iseloomulik keskmine merevee temperatuur sõltuvalt asukohast on 14–15 kraadi läheduses.

Alates augusti lõpust (29. august) on Läänemere idaosas arenenud mere kuumalaine. Praeguse mereleitsaku maksimaalne ulatus oli 10. septembril, kui vee temperatuur oli tavapärasest 4 kraadi kõrgem (olles 19-20 kraadi kandis) ning mere kuumalaine kattis 230 000 ruutkilomeetrit Läänemerest (üle 50%).